聚焦CRO|浅谈寡核苷酸药物代谢产物鉴定

2025-06-23 03:32:17 85

寡核苷酸药物是一类由短链核苷酸组成的药物,它们通过特异性结合到靶标RNA或DNA上,调节基因表达,从而发挥治疗作用。这类药物包括反义寡核苷酸(ASOs)、小干扰RNA(siRNA)、适体(Aptamers)等。寡核苷酸药物的代谢产物分析是药物研发和临床研究中的一个重要环节,它有助于理解药物的代谢途径、生物转化、药效学和毒理学特性。

 

寡核苷酸药物的代谢主要发生在细胞内和体液中,其代谢途径包括核酸酶的降解、化学修饰(如甲基化、硫化等)以及肾脏和肝脏的清除。

 

代谢产物分析通常涉及以下几个步骤:

样品制备:从生物样本(如血液、尿液、组织等)中提取寡核苷酸及其代谢产物。

分离技术:使用高效液相色谱(HPLC)、毛细管电泳(CE)等技术分离寡核苷酸及其代谢产物。

检测方法:通过质谱(MS)、紫外检测(UV)、荧光检测(FLR)等方法对分离的代谢产物进行定性和定量分析。

数据分析:利用生物信息学工具对代谢产物进行鉴定和结构解析,评估代谢途径和代谢动力学。

 

寡核苷酸药物代谢产物分析的挑战包括:

代谢产物的多样性和复杂性:寡核苷酸药物在体内可能产生多种代谢产物,这些产物可能具有不同的生物活性和毒性。

检测灵敏度:由于代谢产物的浓度可能非常低,需要高灵敏度的检测技术。

样品稳定性:寡核苷酸及其代谢产物在样品处理和储存过程中可能发生降解,需要采取适当的稳定措施。

 

寡核苷酸药物代谢产物分析的结果对于优化药物设计、评估药物安全性和有效性、指导临床用药等方面具有重要意义。随着分析技术的不断进步,如高分辨率质谱(HRMS)和代谢组学的发展,寡核苷酸药物代谢产物分析的精度和效率将得到进一步提升。

 

苏州华测生物目前拥有Waters Xevo G3 QTof 高分辨率质谱, 特有的高质量分辨率、灵敏度和可靠性,全扫描和二级碎片采集MSE技术结合,可以全面获得寡核苷酸及代谢产物的质谱信息。寡核苷酸的代谢产物鉴定和未知代谢物序列确认过程复杂,也需要专业的软件进行辅助识别和分析。

 

waters_connect INTACT Mass应用程序,可以自动进行寡核苷酸质量确认,实现更快的样品分析。可定制的化合物库,允许终端用户输入自定义同位素模型,支持自动化核酸确认。

 

waters_connect CONFIRM Sequence应用程序平台,可以自动确认治疗药物及其代谢物的核酸序列,对未知代谢物进行序列确认。给定一个目标核酸序列,CONFIRM Sequence应用程序将自动生成一个预测碎片列表,并搜索这些碎片离子的二级质谱数据,标注所有匹配。该应用程序可以自动处理来自Xevo G3 QTof的MS/MS数据。当处理完成时,一个可视化的“点图”将显示寡核苷酸序列和所有已发现的片段以及序列覆盖率的百分比。

 

苏州华测生物建立了以UPLC-UV-HRMS技术为核心的寡核苷酸代谢及代谢产物分析鉴定研究平台,为客户提供高质量的代谢和代谢产物分析鉴定研究,助力客户的寡核苷酸研发快速推进。

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