寡核苷酸药物具有独特的化学结构,通常采用固相合成工艺制备。然而,这种工艺也带来特殊的质量难题:某些存在于起始物料中的“关键杂质”本身具有反应活性,可以直接参与到后续合成步骤中,形成与目标产物长度相同、结构相近的“全长杂质”。
由于这类杂质与目标药物分子高度相似,在后续的纯化环节中很难被有效去除,可能直接影响最终药品的质量和安全。因此,监管机构对此类物料的变更(如供应商更换)持高度审慎态度,常被视为重大变更。这凸显了从研发伊始就建立科学、严谨的起始物料质量控制体系的极端重要性。华测医药依托完整的技术平台与丰富的项目经验,可为寡核苷酸药物研发提供从核苷亚磷酰胺定制合成、起始物料结构确证、关键杂质鉴定、分析方法开发和质量标准制订的全流程研发和检测服务,助力企业建立科学、合规的质量控制体系。
起始物料的选择应基于充分的工艺理解与风险评估。目前业界通常将以下物料归为化学合成寡核苷酸药物的起始物料:
•核苷亚磷酰胺
•预加载核苷酸的固相载体
•功能性偶联物
•其他(如非预载固体载体、溶剂和色谱填料等)
类别 |
核苷亚磷酰胺 |
预加载核苷酸的固相载体 |
功能性偶联物 |
|
作用 |
药物基本组成单元 |
作为合成起点 |
核苷酸偶联或衍生 |
|
举例 |
脱氧酰胺、2′-修饰酰胺 |
/ |
GalNAc、PEG等 |
|
质控项目 |
性状、鉴别、含量、杂质、纯度、水分和残留溶剂等 |
物理性质、加载亚基的量、质量(性状、鉴别、有关物质、残留溶剂、水分) |
性状、鉴别、含量、杂质、纯度、水分和残留溶剂等 |
(1)脱氧核苷亚磷酰胺(简称脱氧酰胺)
脱氧酰胺通常以发酵来源的天然脱氧核苷为起始物料,经过碱基伯氨基保护、5′-OH DMT(即DMTr)保护,再与磷试剂反应制得。

图1. 脱氧核苷亚磷酰胺的合成路线
脱氧酰胺中常见杂质如下,关键杂质(同时含有磷酰胺基团和DMT保护基团)主要为3′和5′-OH保护基相反的杂质以及碱基未被保护的杂质,必须通过严格的脱氧酰胺质量标准加以控制,其质量标准侧重于控制关键杂质和整体纯度。

脱氧酰胺中常见杂质分析
(2)2′-修饰核苷亚磷酰胺(简称2′-修饰酰胺)
对于2′-修饰的核苷亚磷酰胺(如2′-OMe、2′-F、2′-MOE),以天然核糖核苷为起始物料,首先对2′-OH进行修饰,后续的DMT保护基及合成亚磷酰胺步骤与前述脱氧核苷相同。

图2. 2′修饰酰胺的结构
2′-修饰酰胺中关键杂质如下。除与脱氧酰胺类似的3′和5′⁃OH保护基反向杂质及碱基未保护杂质外,还需重点关注2′-位修饰时产生的非对映异构体杂质、2′-O烷基修饰杂质以及2′和5′⁃OH区域选择性修饰的杂质。其质量控制同样侧重于关键杂质和整体纯度。

2′修饰酰胺中常见杂质分析
(3)其他复杂酰胺
复杂酰胺(如LNAs)的供应链尚不十分完善,且合成路线更为多样,应针对具体合成路线分析潜在的关键杂质。例如,锁核酸(LNA)中的关键杂质可能包括桥环上甲基的异构体以及脱甲基杂质。

图3. 部分复杂酰胺的结构
(4)功能性偶联物
用于寡核苷酸偶联或衍生的非核苷酸部分(如GalNAc、聚乙二醇(PEG)、脂肪酸等),若论证合理,亦可作为起始原料。应重点关注其质量对终产品关键质量属性的影响,并制定合理的质量控制策略,特别要对可能参与后续反应的杂质进行风险评估。目前,GalNAc缀合物在商业化应用方面尚不成熟,需根据其合成工艺及结构特点进行工艺杂质与降解杂质分析。
(5)预加载核苷酸的树脂
预加载核苷酸的固体载体应作为一个整体被指定为起始原料,需结合负载前的游离核苷酸、固体载体本身的质控信息,建立合理的整体质控策略。由于树脂的质量表征方法有限,在论证预加载树脂作为起始物料的合理性时,还需从分析方法能否充分控制关键质量属性(尤其是关键杂质)的角度进行评估。
华测医药拥有完整的分析技术平台与经验丰富的研发团队,可为寡核苷酸起始物料研究提供以下服务:
•定制合成与工艺开发:支持传统及新型核苷亚磷酰胺单体的小试与工艺优化。
•结构确证与杂质谱研究:采用HPLC、³¹P NMR、LC-MS/MS等高灵敏度手段,开展结构解析与杂质溯源。
•分析方法开发与验证:建立涵盖含量、纯度/杂质、水分、残留溶剂等项目的全套检测方法,并支持方法学验证。
•质量标准建立与申报支持:协助企业制定符合监管要求的物料质量标准,并提供申报相关资料撰写支持。
我们致力于以科学、规范的服务,助力企业在寡核苷酸药物研发中筑牢质量基础,推动项目高效进展。
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